DNT ardıcıllığı kimi də tanınan genom ardıcıllığı, orqanizmin genetik materialını təşkil edən DNT molekulunda nukleotidlərin (adenin, sitozin, guanin və timin) sırasının müəyyən edilməsi prosesidir.
Bu ardıcıllıq insan, heyvan, bitki və mikroorqanizmlər də daxil olmaqla orqanizmin tam genetik planını və ya “genomunu” təmin edir.
Genom ardıcıllığı ilə bağlı əsas addımlar bunlardır:
Nümunələrin toplanması: Tərkibində DNT olan bioloji nümunə maraqlı orqanizmdən toplanır. Bu qan nümunəsi, tüpürcək, toxuma biopsiyası və ya digər mənbələr ola bilər.
DNT Extraction: DNT genetik materialı digər hüceyrə komponentlərindən təcrid etmək üçün müxtəlif üsullardan istifadə edərək bioloji nümunədən çıxarılır.
Kitabxananın hazırlanması: Çıxarılan DNT daha kiçik, idarə oluna bilən parçalara bölünür. Bu fraqmentlər daha sonra ardıcıllıq prosesi üçün lazım olan qısa DNT ardıcıllıqları olan adapterlər əlavə edilərək “ardıcıllığa hazırdır”.
Ardıcıllıq: Hazırlanmış DNT fraqmentləri qabaqcıl ardıcıllıq texnologiyalarından istifadə edilməklə ardıcıllıqla tərtib edilir. Müasir ardıcıllıq texnologiyalarına Illumina, PacBio, Oxford Nanopore və başqaları kimi yeni nəsil ardıcıllıq (NGS) üsulları daxildir. Bu texnologiyalar DNT fraqmentlərindəki nukleotidlərin ardıcıllığını oxuyur.
Montaj: Xam ardıcıllıq məlumatları orijinal DNT ardıcıllığını yenidən qurmaq üçün işlənir. Bu addım kontiglər kimi tanınan daha uzun, davamlı ardıcıllıqlar yaratmaq üçün üst-üstə düşən ardıcıllıqların uyğunlaşdırılmasını və birləşməsini əhatə edir.
Genom Annotasiyası: DNT ardıcıllığı yığıldıqdan sonra, genomdakı genləri, tənzimləyici bölgələri və digər funksional elementləri müəyyən etmək və şərh etmək üçün bioinformatika alətlərindən istifadə olunur. Bu addım genləri müəyyən etmək, onların funksiyalarını başa düşmək və onların orqanizmin xüsusiyyətlərinə və davranışlarına necə töhfə verdiyini proqnozlaşdırmaqdan ibarətdir.
Təhlil və şərh: Annotasiya edilmiş genom, genetik varyasyonları, mutasiyaları və digər mühüm xüsusiyyətləri anlamaq üçün təhlil edilir. Tədqiqatçılar orqanizmin biologiyası, potensial xəstəliyə həssaslığı, təkamül tarixi və digər aspektlər haqqında məlumat əldə etmək üçün məlumatları şərh edirlər.
Genom ardıcıllığının geniş tətbiq sahəsi var, o cümlədən:
Tibbi Tədqiqatlar və Klinik Diaqnostika: Xəstəliklərlə əlaqəli genetik variasiyaların müəyyən edilməsi, fərdiləşdirilmiş tibb və erkən xəstəliklərin aşkarlanmasına imkan verir.
Kənd Təsərrüfatı və Məhsulun Təkmilləşdirilməsi: Bitki genomlarını anlayaraq məhsul məhsuldarlığının, xəstəliklərə qarşı müqavimətin və qida dəyərinin artırılması.
Biologiya və Təkamül Tədqiqatları: Müxtəlif orqanizmlərdə təkamül əlaqələri, biomüxtəliflik və uyğunlaşmaların öyrənilməsi.
Əczaçılıq inkişafı: Xəstəliklərin genetik əsaslarını dərk edərək dərmanların kəşfini və inkişafını asanlaşdırmaq.
Məhkəmə Elmləri: Cinayət araşdırmalarında və atalıq testində DNT profili və identifikasiyası.
Ətraf Mühitin Genomikası: Müxtəlif mühitlərdə mikrob icmalarını və onların funksiyalarını öyrənmək, ətraf mühitin monitorinqi və mühafizə səylərinə kömək etmək.
Genom ardıcıllığı bizim genetika anlayışımızda inqilab etdi və müxtəlif sahələrdə irəliləyişlər üçün böyük potensiala malikdir və nəticədə həm elmi tədqiqatlara, həm də bütövlükdə cəmiyyətə fayda verir.
